Ειδικότερα, κρίθηκε ομόφωνα ως αντισυνταγματικός ο τρόπος εκκαθάρισης των αμοιβών των συμβεβλημένων ιατρών του ΕΟΠΥΥ με δειγματοληπτικό έλεγχο 5% των παραστατικών, ενώ αποφασίστηκε ότι η δειγματοληπτική μέθοδος πάσχει, γιατί αφήνει εκτός ελέγχου το 95% των δαπανών και γιατί οι αμοιβές των ιατρών περικόπτονται βάσει στατιστικής πιθανολόγησης, χωρίς πραγματικό έλεγχο και εντοπισμένη τεκμηρίωση.
Το ΣτΕ χαρακτήρισε τη μέθοδο αυτή ως «προδήλως ακατάλληλη για την επίτευξη του σκοπού για τον οποίο θεσπίσθηκε» και τονίζεται ότι αυτή «προσβάλλει τα συνταγματικά δικαιώματα των ιατρών».
Για τους ίδιους δε λόγους κρίθηκε ομοίως αντισυνταγματική η δειγματοληπτική μέθοδος εκκαθάρισης για τα αναδρομικά των ετών 2012-2015. Ενόψει της σοβαρότητας του ζητήματος η υπόθεση παραπέμφθηκε για εκδίκαση στην Ολομέλεια του ΣτΕ.
Σε ανακοίνωσή τους τα μέλη των Ένωσης Ιατρών ΕΟΠΥΥ (ΕΝΙ ΕΟΠΥΥ) δηλώνουν ότι δικαιώθηκαν πανηγυρικά: "Με την απόφαση αυτή το ΣτΕ δέχθηκε ομόφωνα τα επιχειρήματα, που προβλήθηκαν από τον νομικό μας σύμβουλο, ότι ένα εγγενές γραφειοκρατικό πρόβλημα λειτουργίας του ΕΟΠΥΥ (ταχεία εκκαθάριση δαπανών και φόρτος εργασίας), δεν επιτρέπεται να οδηγεί σε απουσία ελέγχου των υποβαλλομένων δικαιολογητικών αλλά και σε στατιστική περικοπή αμοιβών των ιατρών χωρίς εντοπισμένη παραβατικότητα. Στο κείμενο της απόφασης αναφέρεται ότι οι ιατροί οφείλουν να αποζημιώνονται για το σύνολο των υπηρεσιών που παρείχαν".
«Η απόφαση αυτή αποτελεί πανηγυρική δικαίωση της ΕΝΙ ΕΟΠΥΥ, η οποία ανέκαθεν διεκδικούσε τον σεβασμό της αξιοπρέπειας των ιατρών και την πληρωμή των δεδουλευμένων αμοιβών τους», καταλήγουν οι γιατροί.