Κύρια αποστολή της Εθνικής Επιτροπής είναι η γνωμοδότηση επί θεμάτων που αφορούν στην ευζωία, στη στέγαση, στη φροντίδα και τη σωστή χρήση των ζώων εργαστηρίου, η διαρκής εκπαίδευση και επιμόρφωση των ατόμων που ασχολούνται με τα ζώα εργαστηρίου και ο συντονισμός των αντίστοιχων δράσεων με τις Εθνικές Επιτροπές των υπόλοιπων Κρατών Μελών.
Προτεραιότητα της Επιτροπής είναι η αξιολόγηση ορθών πρακτικών στον τομέα της επιστήμης των ζώων εργαστηρίου μεταξύ όλων όσων ασχολούνται με τη βιοϊατρική έρευνα, καθώς και η προαγωγή εναλλακτικών μεθόδων που αντικαθιστούν, μειώνουν ή βελτιστοποιούν τη χρήση των διαφόρων πειραματικών τεχνικών.