Ειδικότερα τα προαναφερόμενα έσοδα κατανέμονται ετησίως, με υπουργική απόφαση, ως εξής: i) ποσοστό τουλάχιστον 60% υπέρ του Ειδικού Λογαριασμού του άρθρου 143 του ν.4001/2011, όπως ισχύει, ποσοστό, που καθορίζεται κατ' ανώτατο όριο με την υπουργική απόφαση, για την ενίσχυση των επιχειρήσεων τομέων και υποτομέων που εκτίθενται σε σημαντικό κίνδυνο διαρροής άνθρακα. Τυχόν ποσό που δεν χρησιμοποιείται για το σκοπό αυτό αποτελεί πόρο του προαναφερόμενου Ειδικού Λογαριασμού.
Παράλλλα ποσοστό, που καθορίζεται επίσης με την υπουργική απόφαση, σε φορέα εποπτευόμενο από το Υπουργείο Περιβάλλοντος και Ενέργειας, για την πραγματοποίηση έργων και την εξυπηρέτηση των οριζόμενων σκοπών (έργα εξοικονόμησης ενέργειας, αντιπυρικά, μείωσης εκπομπών αερίων θερμοκηπίου, προστασίας περιβάλλοντος κ.λπ.). Ο φορέας και η διαδικασία χορήγησης των πόρων καθορίζονται με την ίδια υπουργική απόφαση.
Συγκεκριμένα για την περίοδο 2016-2020 τα έσοδα από πλειστηριασμούς αδιαθέτων δικαιωμάτων εκπομπών αερίων θερμοκηπίου κατανέμονται ετησίως με απόφαση του Υπουργού Περιβάλλοντος και Ενέργειας ως εξής:
(α) Ποσοστό τουλάχιστον 60% των εσόδων αποτελεί πόρο του Ειδικού Λογαριασμού του άρθρου 143 του ν.4001/2011, όπως ισχύει.
(β) Ποσοστό των εσόδων, το οποίο θα καθοριστεί κατ' ανώτατο όριο με την υπουργική απόφαση ϋα καλύπτει τις ανάγκες της ενίσχυσης για επιχειρήσεις τομέων και υποτομέων που εκτίθενται σε σημαντικό κίνδυνο διαρροής άνθρακα, όπως προβλέπεται στην υπ' αριθμ. ΚΥΑ ΑΠ/21906/2014 (ΦΕΚ Β'3304). Τυχόν ποσό, το οποίο δεν χρησιμοποιείται για τον παραπάνω σκοπό αποτελεί πόρο του Ειδικού Λογαριασμού του άρθρου 143 του ν.4001/2011, όπως ισχύει.
Τα ανωτέρω ποσοστά καθορίζονται κατόπιν σχετικής γνώμης της ΡΑΕ, βάσει της εξέλιξης των εκροών και εισροών του Ειδικού Λογαριασμού.
(γ) Ποσοστό των εσόδων, το οποίο θα καθοριστεί με την υπουργική απόφαση, διατίθεται σε φορέα, εποπτευόμενο από το Υπουργείο Περιβάλλοντος και Ενέργειας, για την πραγματοποίηση έργων και την εξυπηρέτηση ορισμένων από τους σκοπούς, που περιγράφονται στην Οδηγία 2003/87/ΕΚ όπως έχει τροποποιηθεί και ισχύει, και συγκεκριμένα, σε έργα εξοικονόμησης ενέργειας με την υποστήριξη χαμηλών εισοδημάτων κατά προτεραιότητα, σε έργα που αποσκοπούν στη μείωση των συμβατικών καυσίμων από μεταφορές, σε αντιπυρικά έργα καθαρισμού και διαχείρισης, με σκοπό την διατήρηση και αύξηση του αποθέματος των δημοσιών και ιδιωτικών δασών καθώς και σε έργα σε αναπτυσσόμενες ή τρίτες χώρες με σκοπό τη μείωση των εκπομπών αερίων του θερμοκηπίου και την προσαρμογή στην κλιματική αλλαγή και σε έργα για την προστασία, διατήρηση και βελτίωση του φυσικού περιβάλλοντος. Με την ίδια υπουργική απόφαση καθορίζεται ο φορέας και η διαδικασία χορήγησης των πόρων για τους σκοπούς της τελευταίας περίπτωσης.