Η εν λόγω εισαγγελική διάταξη δεν επικυρώθηκε από το Συμβούλιο Πλημμελειοδικών, το οποίο αποφάνθηκε ότι δεν συντρέχει λόγος δημοσίου συμφέροντος. Κατόπιν αυτών, ο εφοπλιστής ζήτησε από την ελληνική αστυνομία να του επιστραφεί το διαβατήριο που του είχε αφαιρεθεί.
Ο κ. Μαρνάκης έχει προσφύγει και στο Συμβούλιο της Επικρατείας, ζητώντας να κριθεί αντισυνταγματικό το προεδρικό διάταγμα, με το οποίο του κρατήθηκε το διαβατήριο.