Η ΥΠΕΔΥΦΚΑ έχει προβεί σε ελέγχους από τους οποίους αποδίδονται ευθύνες σε ιατρούς για ζητήματα τα οποία όμως δεν έχουν νομικό έρεισμα. Ειδικότερα όπως αναφέρει ο ΙΣΑ, κατηγορούνται ιατροί ότι συνταγογράφησαν φάρμακα εκτός ειδικότητας, αν και εν τέλει αποδεικνύεται ότι ορθά ανέγραψαν τα συγκεκριμένα σκευάσματα, καθότι ήταν εντός του γνωστικού αντικειμένου τους. Επίσης πολλές φορές οι ιατροί βρίσκονται απολογούμενοι για ζητήματα γραμματειακά και ουχί ιατρικά λόγω του φόρτου εργασίας και της συνεχιζόμενης αλλαγής του συστήματος ηλεκτρονικής συνταγογράφησης.
Ο ΙΣΑ όπως τονίζει, είναι υπέρμαχος του ελέγχου ώστε να μην υφίστανται ζητήματα πλημμελούς άσκησης του ιατρικού λειτουργήματος πλην όμως πρέπει οι έλεγχοι να πραγματοποιούνται με ιατρικά κριτήρια και όχι με λογιστικά. Η άσκηση της ιατρικής είναι καθήκον του ιατρού και δεν πρέπει να παρακωλύεται αλλά να προωθείται.